Фамилия Фялковский — редкий и интересный случай в русском ономастиконе. Её основа и суффикс указывают на польские корни, но бытование в России привело к характерной адаптации.

Словообразовательная модель типична для польских фамилий: суффикс -ский (польск. -ski) присоединён к топонимической основе. Такие фамилии в Польше давали по названию места жительства или владения. В основе лежит, скорее всего, название населённого пункта вроде Фялково или Фялки. Само слово «Фялка» — это польское диалектное или старопольское название фиалки (современное польск. fiołek). Таким образом, Фялковский — это «тот, кто из Фялкова», а само село, вероятно, получило имя по фиалкам, росшим в округе.

В русском языке эта фамилия подверглась фонетической адаптации. Исходное польское произношение — с мягким «л» (близко к «Фяуковский»), но в русской среде твёрдый звук «л» закрепился. Это отличает её от однокоренных фамилий вроде Фиалковский (с более книжным, латинским корнем) или Филипповский (от имени Филипп).

Географически фамилия Фялковский встречается в основном в западных регионах России, а также в Беларуси, что подтверждает её польско-литовское происхождение. Сословно носители чаще всего были шляхтой или мещанами, так как фамилии на -ский в Польше изначально были дворянскими, но со временем распространились и среди крестьян. В Российской империи после разделов Речи Посполитой многие такие фамилии вошли в состав русского дворянства или мещанства.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с литовским словом fialka (фиалка) через польское посредство. Но она не меняет сути — в любом случае фамилия цветочная, топонимическая и указывает на происхождение из мест, где фиалка была заметным растением.