Фамилия Габсаттаров — редкий случай, когда географический адрес основы почти наверняка перевешивает любые другие версии. Её корень — не арабское имя и не тюркское прозвище, а конкретный топоним, что для русских фамилий татарского и башкирского происхождения встречается реже, чем отчества от имён.

Основа «Габсаттар» — это искажённое на русский лад название деревни Габбас (или Габбасово) с характерным для башкирского языка суффиксом принадлежности. В Башкортостане и Оренбургской области есть несколько селений с похожими названиями (например, Габбасово в Куюргазинском районе). Фамилия образована по продуктивной модели: топоним + суффикс -ов, который в русской среде стал универсальным патронимическим и посессивным маркером. То есть Габсаттаров — буквально «выходец из Габбаса» или «принадлежащий к роду из Габбаса».

Менее вероятна, но не исключена версия от арабского имени Габбас (Аббас) — «хмурый», «суровый». В этом случае фамилия была бы Габбасов или Аббасов, а форма с -т- и -тар- — результат народной этимологии, когда имя переосмыслили через татарское «саттар» (продавец) или башкирское «сат» (торговать). Однако филологически это слабое место: суффикс -тар в тюркских языках — показатель множественного числа, и «Габсаттаров» тогда значило бы «из рода Габсаттаров», что снова отсылает к родовому селу, а не к личному имени.

Сословная принадлежность предков неясна: носители фамилии встречаются и среди тептярей, и среди башкир-вотчинников. Точнее можно сказать, что фамилия закрепилась в юго-восточных районах Башкирии и в соседней Челябинской области — там, где компактно живут башкиры и татары, сохранившие привязку к родовым деревням. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на последний слог: Габсаттаро́в, что типично для тюркских основ, обрусевших через суффикс.

Если искать параллели, то однокоренные фамилии — Габбасов, Габбасович, Габсалимов, Габсаттаров — образуют гнездо, объединённое корнем «габбас» и указывающее на конкретные родовые гнёзда в Приуралье.