Фамилия Гарайшины — редкий пример, где в основе лежит не просто тюркское имя, а двухкорневая конструкция из тюркского и персидского. Исходное имя — Гарайша (или Гарайшах). Первая часть, Гарай, восходит к татарскому языку и означает «стремление», «желание», «достоинство» или «могущество». Вторая часть, шах, — персидский титул, который в составе мужских имен указывает на превосходную степень: «самый лучший», «самый главный», «повелитель». Вместе имя Гарайша переводится как «самое лучшее стремление» или «высокое достоинство».

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Гарайш- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). То есть Гарайшины — это «дети (потомки) Гарайши». Такое смешение тюркского имени и славянского суффикса — характерный признак фамилий, возникших в среде служилых людей и дворянства XV–XVII веков, когда в России активно шёл процесс адаптации выходцев из Орды.

Сами Гарайшины, скорее всего, ведут род от человека, носившего имя Гарайша. Временной отрезок — XV–XVII века, когда тюркские имена ещё не вытеснились христианскими, но уже фиксировались в русских документах. Фамилия не получила широкого распространения, что говорит о локальном бытовании: вероятно, род был немногочисленным или сосредоточенным в одном регионе, например, в Поволжье или на Урале, где традиционно сильны татарские и башкирские корни.

В отличие от многих восточных фамилий, оканчивающихся на -ов/-ев, здесь использован суффикс -ин, который в русской антропонимии чаще встречается у фамилий, образованных от основ на -а/-я. Это косвенно указывает, что имя Гарайша воспринималось как полное, а не сокращённое.