Фамилия Гардюта звучит необычно для русского уха, но её происхождение укладывается в несколько логичных версий. Самое надёжное объяснение — украинское или белорусское. В этих языках существует слово «гард» или «гарда», которое восходит к польскому garda (стража, охрана) или немецкому Garde (гвардия). Суффикс «-юта» — характерный для западноукраинских и южнобелорусских фамилий уменьшительный или прозвищный формант (сравните: Костюта, Масюта). Таким образом, Гардюта — это, скорее всего, прозвище сына или потомка человека, связанного со стражей: либо сторожа, либо военного из гарнизона, либо того, кто нёс караульную службу. В переносном смысле «гардой» могли назвать надёжного, бдительного человека.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с литовским словом gardas (загон, огороженное место). В таком случае Гардюта могло быть прозвищем пастуха или крестьянина, жившего у огороженного выпаса. Литва и историческая территория Великого княжества Литовского (куда входили земли современной Беларуси и Украины) — естественная зона бытования фамилий с такой основой. Спорной выглядит попытка вывести фамилию из тюркского gard (крепость) — для этого нет ни географических, ни исторических подтверждений.

Словообразовательная модель фамилии указывает на то, что она сложилась не как патроним (сын такого-то), а как прозвище, которое закрепилось за родом. Суффикс «-юта» в украинской ономастике часто придавал фамилии оттенок «малый, молодой» или просто указывал на принадлежность к определённому лицу (Гардюта — «тот, кто относится к Гарде»). Фамилия редкая, основная зона её фиксации — западные области Украины (Волынь, Ровенщина, Тернопольщина) и юго-восток Польши. Встречается она и среди переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке, куда украинские крестьяне активно мигрировали в конце XIX — начале XX века.

Несмотря на внешнюю «иностранность», фамилия Гардюта — чисто славянская по способу образования, хотя корень у неё заимствованный. Правописание устойчивое: через «Г» в начале и «ю» в середине. Варианты вроде «Гардута» или «Гордюта» — либо опечатки, либо результат местной диалектной замены гласных, но исходной формой считается именно Гардюта.