Фамилия Гайбадулин образована от мужского тюркского имени Хайбулла, которое в переводе с арабского означает «секрет Аллаха, тайна, которой ведает Аллах». В основу фамилии лег диалектный вариант имени — Гайбадул. Согласно другой гипотезе, в основу фамилии лег диалектный вариант имени Габдулла - «раб, слуга Аллаха» - Гайбадул.