Фамилия Гайфер, скорее всего, происходит от прозвища, которое указывало на географическое происхождение человека. В основе лежит топоним Хайфа — третий по величине город Израиля, крупный морской порт, расположенный на склонах горы Кармель. К названию города добавили суффикс жителя -ер, характерный для некоторых языков, и получилось слово «Гайфер» — то есть выходец из Хайфы.

Само название города Хайфа имеет несколько версий происхождения. По одной из них, оно восходит к ивритскому словосочетанию «хоф яфе», что значит «красивый берег». Другая версия связывает топоним с еврейским корнем «хапа» — «укрывать», поскольку гора Кармель служит городу естественной защитой. Есть и гипотеза, что название произошло от арамейского «хаффа» — «берег».

Интересно, что модель образования фамилии от названия города с помощью суффикса -ер встречается не только в этой фамилии. В еврейской среде были распространены фамилии, образованные по схожему принципу, но от немецких основ: Вейценбаум («пшеничное дерево»), Зауэрштром («кислый поток»), Левенфиш («рыба-лев»), Цигенбаум («козье дерево»), Квечман («тот, кто высказывается неохотно»). В отличие от этих примеров, фамилия Гайфер сохраняет прямую связь с реальным географическим объектом, а не с абстрактным прозвищем.