Фамилия Гебенов — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а арабское имя. Её образовали от мужского имени Гебен, которое восходит к арабскому «хабиб» — «любимый», «друг». В арабской традиции это одно из имён-пожеланий: родители давали его ребёнку, желая ему любви окружающих и счастливой судьбы. Подобные обрядовые имена, означающие благо (здоровье, храбрость, удачу), существовали во многих культурах, и здесь мы видим тот же принцип.

Фамилия построена по стандартной русской модели: к основе Гебен прибавили патронимический суффикс -ов. Так на Руси оформляли фамилии от имён, прозвищ или профессий отца: Гебенов буквально значит «сын Гебена». Со временем суффикс утратил значение прямого родства и закрепился как фамильный.

Наибольшее распространение фамилия получила на Северном Кавказе, особенно среди кумыков и других тюркоязычных народов Дагестана. Это не случайно: в регионе веками соседствовали арабская письменность, исламская культура и местные языки, поэтому арабские имена легко входили в обиход, а затем оформлялись по русским грамматическим нормам, когда в XIX–XX веках фиксировались фамилии.

Спорных версий здесь нет: корень прозрачен, а альтернативные толкования (например, от немецкого «geben» — «давать») лишены исторической и географической опоры. Для носителя фамилии это значит, что его предки, скорее всего, жили в мусульманской среде Кавказа, а имя родоначальника несло пожелание добра и любви — редкий и тёплый смысл для фамильного предания.