Фамилия Гегна — редкая и необычная для русского уха. Её основа и звучание сразу указывают на нерусское происхождение, и здесь есть над чем разобраться.

Скорее всего, фамилия Гегна имеет западноевропейские корни. Самый прямой путь — от немецкой фамилии Gegner, что означает «противник», «соперник». В немецком языке это слово восходит к глаголу «gegen» (против). Однако в русской записи конечное «-er» могло отпасть или трансформироваться в «-а», дав форму Гегна. Такое переоформление типично для фамилий немецких колонистов, переселявшихся в Россию в XVIII–XIX веках, особенно в Поволжье и Причерноморье.

Есть и другая, менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом. В Швейцарии существует коммуна Гегна (Gegna) в кантоне Тичино. Фамилия могла возникнуть как указание на выходца оттуда. В этом случае суффикс «-а» работал бы как русское окончание, адаптирующее иноязычное название.

В русском языке фамилия стоит в форме родительного падежа с окончанием «-а», что характерно для фамилий, образованных от прозвищ или иностранных основ, не подходящих под стандартные модели на «-ов» или «-ин». Она не склоняема по падежам в мужском роде (Иван Гегна, к Ивану Гегне), что тоже выдает её иноязычное происхождение.

Встретить фамилию Гегна можно в основном среди потомков немецких колонистов, а также в семьях, имеющих швейцарские или австрийские корни. В дореволюционных метрических книгах лютеранских приходов она могла писаться как «Гегнер» или «Гегна», а после русификации закрепилась в нынешнем виде.