Фамилия Гельбутовский — редкий случай, когда практически всё в её строении указывает на географическое происхождение, но сам топоним неочевиден. Суффикс -овск- в сочетании с окончанием -ий — классическая модель для польской и западнорусской шляхетской фамилии, образованной от названия места. Человек, получивший такую фамилию, скорее всего, был Гельбутовским — то есть владельцем или уроженцем имения Гельбуты или Гельбутово.

Основа «Гельбут» настораживает: в ней слышится немецкое или балтское звучание. Вероятнее всего, она восходит к литовскому или древнепрусскому корню. В литовском языке есть слово «gelbėti» — «спасать, помогать», от которого могло образоваться прозвище Гельбутис («спаситель»). В польско-литовском пограничье такие прозвища нередко становились основой для названий усадеб. Менее убедительна версия о связи с немецким «Gelb» (жёлтый) — фамилии с цветовым корнем обычно образуются иначе и редко получают столь развёрнутый суффикс.

Географически фамилия тяготеет к бывшим землям Великого княжества Литовского — современной Беларуси, Литве и восточной Польше. В польских гербовниках XIX века упоминается шляхетский род Гельбутовских герба «Лис», но документальных подтверждений их древнего происхождения немного. Сословно носители фамилии — это, скорее всего, мелкопоместная шляхта или однодворцы, которые после разделов Речи Посполитой вошли в состав российского дворянства, но не всегда могли подтвердить свой статус.

Интересная деталь: в русских переписях XIX века фамилия иногда записывалась как «Гельбутовский», а иногда — «Гильбутовский» (через «и»), что отражает колебания в произношении мягкого литовского звука. Сегодня фамилия встречается редко, в основном в западных областях России, Беларуси и среди потомков эмигрантов первой волны.