Фамилия Геокчакян — яркий пример армянского родового именования, образованного от географического названия. В основе лежит топоним Геокча (или Гёкча) — историческое название озера Севан в Армении. По-тюркски «гёк» (gök) означает «голубой», а «ча» — уменьшительный суффикс, то есть Гёкча — «голубоватое» или «синеватое». Так озеро называли в Османской империи и Персии, отмечая необычный цвет воды.

Суффикс -ян (в исходной форме -янц) — самый распространённый в армянской ономастике, он указывает на принадлежность к роду: «из Геокчи», «родом с берегов Геокчи». Таким образом, Геокчакян — это «севанец», человек, чьи предки жили в окрестностях Севана. В самой Армении фамилия чаще звучит как Геокчаян или Гёкчаян, а вариант с проставленным «к» — Геокчакян — результат орфографического колебания при передаче тюркского названия через русский язык.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии — выходцы из рыбацких или приозёрных сел Гехаркуникской области. В XIX веке многие армяне, переселявшиеся из Восточной Армении в другие регионы Российской империи, брали фамилию по месту исхода, чтобы сохранить память о родине. Геокчакян — редкий случай, когда топоним не просто указывает на местность, а несёт в себе яркий образ: «голубое озеро».

Встречается фамилия и в диаспоре — у потомков армян, покинувших Западную Армению после геноцида 1915 года. Там написание могло меняться: например, Геокджаян или Кёкчаян, но корень остаётся тем же.