Фамилия Гербенская звучит так, будто её носительница родом из мест с названием Гербенки, Гербеново или Гербень. И это первое, что приходит в голову: перед нами типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + суффикс -ск- + окончание -ая». Такие фамилии в России чаще всего получали выходцы из духовного сословия (семинаристы) или дворяне, которым жаловали земли, но в случае с Гербенской корни, скорее всего, уходят в польскую или западнорусскую традицию.

Суффикс -ск- указывает на принадлежность к чему-то или происхождение откуда-то. В польской ономастике фамилии на -ский (-ska) — одни из самых массовых, и они часто образовывались от названий имений или деревень. Если предположить, что основа «Гербен-» — это искажённое или адаптированное на русской почве название, то можно вспомнить польское слово «herb» (герб) или немецкое «Herb» (горький, терпкий). Однако гораздо правдоподобнее, что в основе лежит топоним Гербены — такое село существует на Украине (Винницкая область), и его название, в свою очередь, может восходить к личному имени Герб (сокращение от Герберт) или к прозвищу человека, связанного с гербами (например, составителя гербов).

В России фамилия Гербенская встречается крайне редко. Если искать её в исторических документах, то, скорее всего, она принадлежала женщине из обедневшего шляхетского рода или дочери священника, которого перевели служить в приход с таким названием. Мужской вариант — Гербенский — был бы более распространён, но в женской форме фамилия сохранила архаичное окончание, типичное для старой русской аристократии и духовенства (сравните: княжна Волконская, поповна Спасская).

Есть и альтернативная, хотя и более спорная версия: фамилия могла возникнуть не от названия места, а от прозвища «Гербеня» — так могли называть человека с горьким, «гербеным» характером (от диалектного «гербеть» — горчить, киснуть). Но эта гипотеза слабее, потому что суффикс -ск- в чистом виде редко присоединяют к личным прозвищам — для этого обычно используют -ов или -ин. Поэтому версия с топонимом остаётся основной.

Таким образом, носительница фамилии Гербенская, вероятно, имеет предков либо из западнорусских или польских земель, где было селение Гербены, либо из среды духовенства, где фамилии по названиям приходов давали массово и нередко — в женском роде, как записали в метрике.