Фамилия Гермизеева на первый взгляд кажется иноязычной, но её корни уходят в тюркскую ономастику, которая веками переплеталась с русской. В основе фамилии лежит мужское личное имя Гермиз (или Гармиз), которое восходит к тюркскому «кермиз» — так называли особый сорт красной краски, а также драгоценный камень, рубин или гранат. В переносном смысле имя могло означать «красный», «румяный» или «драгоценный», что было типично для восточных имён-пожеланий красоты и удачи.

Фамилия образована по русской модели с типичным суффиксом принадлежности -ев, который присоединяли к основам, оканчивающимся на согласный. Суффикс -ин здесь не появился, потому что основа не на -а/-я. Таким образом, Гермизеев — это буквально «сын (или потомок) Гермиза». Женская форма Гермизеева — это вариант по мужской линии, закрепившийся в документах.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России и Поволжью, где исторически было сильное тюркское влияние. Встречается она в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Астраханской областях. В этих местах имя Гермиз не было редкостью среди татар, башкир и чувашей, а после крещения многие носители получали фамилии по отцу, используя привычную русскую форму.

Словообразовательная модель здесь интересна тем, что суффикс -еев (а не -ов) встречается реже и часто указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий или шипящий согласный. В случае с Гермизеевым мы видим, что исходное имя звучало как Гермиз, а не Гермиза, иначе фамилия была бы Гермизин. Это подсказывает, что имя бытовало в твёрдой форме, без окончания -а, свойственного русским заимствованиям.

Споров о происхождении фамилии почти нет: тюркская версия с «красным камнем» — основная и убедительная. Альтернативные гипотезы, связывающие фамилию с греческим «гермес» или немецким «герц», выглядят натянутыми, поскольку не находят подтверждения ни в географии бытования, ни в типичных моделях русских фамилий тюркского происхождения. Сословно предки Гермизеевых могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми (например, толмачами или казаками), но точных данных по сословию нет — фамилия не относится к дворянским родам, внесённым в родословные книги.