Фамилия Гейштеров — редкий случай, когда географический корень почти очевиден, а суффикс ставит в тупик. Основа «Гейст» (нем. Geist — дух, призрак, ум) указывает на немецкое или еврейское (ашкеназское) происхождение. В немецкой ономастике Geist могло быть прозвищем мечтателя, остроумного человека или, напротив, того, кого считали «не от мира сего». Однако фамилия оформлена русским патронимическим суффиксом -ов, что типично для обрусевших немецких фамилий: предка звали Гейст, а его сын стал Гейстеровым, то есть «Гейстов сын». Но здесь окончание -еров, а не просто -ов, что наводит на другую версию.

Возможно, исходная форма — Гейстер, а не Гейст. В немецком языке суффикс -er часто обозначает профессию или жителя местности. Гейстер — тот, кто имеет отношение к духу (например, спирит, заклинатель) или, что прозаичнее, уроженец места с корнем «Гейст» (есть топонимы Geist в Вестфалии и Баварии). Тогда Гейштеров — это уже русифицированная версия: к немецкой основе прибавили русский суффикс принадлежности, чтобы подчеркнуть: «из рода Гейстеров». Фонетическая вставка «ш» (Гейш- вместо Гейст-) могла возникнуть под влиянием произношения в южнорусских или украинских говорах, где смягчают или заменяют «ст» на «шт» (сравните: «мост» — «мошт» в диалектах).

Есть и более простая версия: фамилия могла быть записана как Гейштер (от нем. Geister — «духи» во множественном числе), а затем при склонении или в документах превратилась в Гейштеров. В любом случае, носители фамилии — потомки выходцев из немецкоязычных земель, которые переселились в Российскую империю в XVIII–XIX веках (чаще всего колонисты Поволжья, Причерноморья или Прибалтики). Сословно это могли быть ремесленники, крестьяне или мелкие чиновники, но не дворяне: немецкие фамилии на -ов редко встречались у знати, так как русское дворянство предпочитало сохранять оригинальное написание.

Написание с буквой «ё» (Гейштёров) встречается, но редко и скорее как ошибка переписчика. Ударение, по аналогии с фамилиями на -еров (например, Костюков, но Гейштеров), падает на первый слог: Ге́йштеров. Фамилия крайне редкая, в современных базах данных встречается единично, в основном в центральной России и на юге Украины.