Фамилия Гежоян — яркий пример армянской модели фамильного именования, указывающей на происхождение рода. Её основа — Гежо — является, скорее всего, вариантом имени или прозвища, а окончание -ян (в более архаичной форме -янц) означает «из рода такого-то» или «принадлежащий». Таким образом, Гежоян — это потомок человека по имени или прозвищу Гежо.

Корень «геж» в армянском языке имеет несколько возможных значений, и здесь есть пространство для лингвистической дискуссии. Самое прямое толкование — от слова «геж» (գեժ), которое переводится как «смешной», «забавный», «чудаковатый». Прозвище Гежо мог получить человек с весёлым нравом, озорник или тот, кто любил шутить. Однако в диалектах это слово могло иметь и другие оттенки: в некоторых областях «геж» означало «слепой» или «плохо видящий» (сравните с армянским «гежналь» — ослепнуть). В таком случае прозвище давалось человеку с плохим зрением. Третья версия — антропонимическая: Гежо может быть сокращением от полного имени, например, от Геворг (Георгий) или Егише, где произошла диалектная замена начальных звуков.

Суффикс -о в основе (Гежо) — это типичный для армянских прозвищ и имён ласкательный или уменьшительный формант. Он превращает корень в личное именование, к которому затем прирос фамильный патронимический суффикс. По модели образования фамилия Гежоян стоит в одном ряду с такими распространёнными армянскими фамилиями, как Петросян (от Петрос), Арутюнян (от Арутюн) или Варосян (от Варос). Разница лишь в том, что основа здесь не каноническое имя, а прозвищное или диалектное.

География фамилии традиционно связана с историческими областями Западной Армении, особенно с регионом Васпуракан (современная Турция, район озера Ван) и Сасун. После геноцида армян 1915 года носители фамилии рассеялись по миру, и сегодня Гежоянов можно встретить в Армении, России, странах Ближнего Востока и в диаспоре. В русскоязычной среде фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине (Иван Гежоян), и склоняется, если принадлежит женщине (Анны Гежоян). Ударение, как правило, падает на последний слог — Гежоян, хотя в диаспоре иногда встречаются варианты с ударением на второй слог.