Фамилия Гибулина — вариант, образованный от мужской формы Гибулин, а та, в свою очередь, от прозвища или имени Гибула. Основа здесь — тюркское слово «гиба» или «гиб», которое в разных диалектах означает «горб», «изгиб», «кривизна». Человек с таким прозвищем мог быть сутулым, горбатым или просто иметь какую-то характерную особенность осанки. В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, корень «гиб» встречается в словах, связанных с искривлением, — не обязательно физическим, иногда переносным, вроде «криводушный», хотя для прозвища вероятнее внешний признак.

Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Гибулин, то есть сын или потомок Гибулы. Модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а: как Пушкин от Пушки, Репин от Репы, так и Гибулин от Гибулы. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Гибу́лин, хотя в разговорной речи встречается и вариант с ударением на первый.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием — Поволжье, Урал, Западная Сибирь. У башкир и татар распространены фамилии с похожей основой: Гибадуллин, Гибатов, где корень «гиб» смешивается с арабским «гибад» (раб, слуга). Но в случае с Гибулиным арабская этимология маловероятна — слишком короткая и простая основа, типичная именно для тюркских прозвищ, а не для сложных теофорных имен.

Встречается и русская версия: от редкого дохристианского имени Гибула, которое могло быть производным от «гибель» или «губить» — в древнерусских говорах «гибула» иногда означало «разрушитель», «вредный человек». Но это спорная гипотеза, так как в письменных источниках такое имя не фиксируется, а фамилия почти не встречается в центральных русских областях. Зато в среде крещеных татар и башкир она обычна — предки носителей фамилии могли быть крестьянами или ремесленниками, получившими прозвище за внешность.

Фамилия редкая, не аристократическая, не дворянская — в старых родословных книгах её нет. Это фамилия простых людей, чей род, скорее всего, пошел из тюркоязычной среды, принявшей православие или сохранившей ислам.