Фамилия Гиндеберя — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любые попытки найти славянский корень. Скорее всего, перед нами фамилия молдавского или румынского происхождения, адаптированная русским языком. В румынском языке есть слово «ghinde» — тыква-горлянка, лагенария, из которой делают фляги и посуду. Суффикс «-беря» в таком случае может быть искажением румынского «-bere» (питьё, пиво) или просто народным переосмыслением исходного прозвища. Прямой аналог — фамилия Гинда, которая встречается в Молдове и на юго-западе Украины.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа «гинд» может восходить к тюркскому корню со значением «пять» («беш» в другой огласовке). Однако для фамилии такой переход редок, и тюркская гипотеза проигрывает молдавской из-за характерного окончания «-еря», которое хорошо ложится на румынскую модель образования прозвищ.

Интересно, что фамилия Гиндеберя не фиксируется в классических словарях русских фамилий (Унбегаун, Никонов, Веселовский) — это верный признак её недавнего или локального бытования. Основной ареал — Молдова, Приднестровье, Одесская область Украины. Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян или ремесленников, получивших прозвище по предмету быта: либо человека, делавшего тыквенные фляги (гинды), либо того, кто их постоянно носил. Ударение в русском языке обычно падает на второй слог: Гинде́беря.