Фамилия Гисар — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. В ней нет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает: перед нами либо позднее заимствование, либо фамилия, образованная от прозвища без изменений (так называемая «окаменевшая» форма). В русской традиции фамилии без суффикса чаще всего встречаются у украинцев, белорусов или выходцев из западных регионов, а также у духовенства, где искусственно создавали фамилии из латинских или греческих корней.

Сам корень «Гис-» может вести к нескольким источникам. Самая прямая версия — немецкая или еврейская (ашкеназская) основа. В немецком «Gießer» означает «литейщик» или «тот, кто льет металл». Фамилия могла попасть в Российскую империю вместе с переселенцами-ремесленниками из Германии (например, в Поволжье) или через еврейское население, где профессиональные прозвища часто становились фамилиями. В таком случае Гисар — это искаженное на слух «Гиссер»: окончание «-ар» вместо «-ер» могло появиться под влиянием южнорусских говоров или польского языка.

Вторая версия — тюркская. В языках Средней Азии «гиссар» (от арабского «хисар») означает «крепость», «укрепление». Это слово известно по названию Гиссарской долины в Таджикистане. Фамилия могла возникнуть у таджиков или узбеков, чьи предки жили в тех местах, а затем, при переезде в русскоязычную среду, была записана как Гисар. В этом случае фамилия — топонимическая, указывающая на родину или место жительства.

Третья, менее вероятная версия — от греческого слова «гиссар» (разновидность растения) или от личного имени Гис (сокращение от Гисберт). Но эти гипотезы не имеют серьезной опоры в ономастических словарях.

Географически фамилия Гисар сегодня встречается в России крайне редко, в основном в южных регионах и в крупных городах. Встречается она и у татар, и у русских, и у людей с немецкими корнями. Однозначно определить происхождение без генеалогического исследования семьи невозможно, но профессиональная версия (литейщик) выглядит самой логичной: фамилии ремесленников часто оставались без изменений и хорошо сохранялись в документах XVIII–XIX веков.