Фамилия Глонин — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием -ин скрывается корень, уходящий в соседний славянский язык. В основе фамилии лежит прозвище Глоня. Скорее всего, оно восходит к польскому glon, у которого два совершенно разных значения: «водоросль» и «краюха, ломоть». Вторая версия выглядит более убедительной для прозвища: Глоней могли назвать бедняка или нищего, который просил подаяние — тот самый ломоть хлеба. Первое значение («водоросль») тоже не исключено, но оно дало бы скорее насмешливое прозвище, возможно, за неопрятный вид или профессию, связанную с водой и тиной.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Глонин, то есть сын или потомок Глони. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. Сама фамилия редкая, и её география в современных справочниках невелика — она встречается точечно, преимущественно в центральных и западных регионах России, что косвенно подтверждает её польские или западнорусские корни.

Из-за редкости фамилии точное время её возникновения установить сложно. Процесс закрепления прозвищ в качестве фамилий шёл несколько столетий, и Глонины могли появиться как в XVI–XVII веках, так и позже, в среде крестьян или мещан. Сословная принадлежность исходных носителей неясна, но «нищее» прозвище намекает на простое происхождение.

Кстати, стоит заметить, что фамилия Глонин — не единственная, образованная от этого корня. В польской ономастике встречается Глонь (Głoń) и Глоны (Głony), а в русской записи похожая основа могла дать и фамилию Глонов. Разница в суффиксах (-ов и -ин) связана с тем, от какого окончания исходного прозвища шло образование: Глоня даёт Глонин, Глон — Глонов.