Фамилия Гоишин — один из тех случаев, когда внешне простая основа скрывает неочевидное происхождение. На первый взгляд она укладывается в типичную русскую модель с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Гоишин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Гоиша. Но что такое «Гоиша»? Здесь начинается главное.

Самая вероятная версия — тюркские корни. В языках тюркской группы (татарском, башкирском, казахском) слово «гой» или «кой» означает «овца», а уменьшительно-ласкательная форма «гойша» — «овечка», «барашек». В русской среде такое прозвище могли дать пастуху, овцеводу либо человеку с кротким, «овечьим» нравом. Суффикс -ин оформил фамилию по русскому образцу, что типично для фамилий тюркского происхождения в Поволжье, Приуралье и южных регионах России. География фамилии это подтверждает: Гоишины встречаются в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области.

Менее убедительная, но возможная версия — искажение при записи фамилии Гойшин или Гайшин. В этом случае основа могла восходить к крестильному имени Гай (редкая форма от Гавриила) или к прозвищу от диалектного «гай» — лес, роща (южнорусское). Однако такая гипотеза слабее: фамилия Гоишин с буквой «о» в корне устойчиво фиксируется в документах, а не как случайная описка.

Третья версия, которую иногда выдвигают, — связь с еврейской фамилией Гойшин (от «гой» — народ, нееврей). Но это маловероятно: суффикс -ин в еврейских фамилиях ашкеназского происхождения встречается редко, а сама фамилия не зафиксирована в известных словарях еврейских фамилий. К тому же «гой» в иврите — нейтральное слово, вряд ли ставшее основой для прозвища в русской среде.

Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, без громких носителей в истории. Её ценность — в бытовом, живом корне, который связывает предка с конкретным занятием или чертой характера, а не с книжным именем.