Фамилия Гондаленко — яркий пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -енко, который в XVI–XVIII веках был главным маркером «сыновства» или принадлежности к роду. Буквально: «маленький Гондал» или «потомок человека по прозвищу Гондал». В украинской ономастике фамилии на -енко считаются типичными для Поднепровья, Полтавщины и Черниговщины — регионов, где формировалось казачество.

Основа фамилии — прозвище Гондал. Его происхождение неоднозначно, но наиболее убедительная версия связывает его с диалектным украинским или польским глаголом gondalić (болтать, говорить вздор, пустословить). В таком случае Гондал — это человек с характерной манерой речи: говорливый, возможно, балагур или сплетник. Прозвища по речевым особенностям были распространены в крестьянской и казачьей среде, где меткое слово закреплялось за человеком на всю жизнь.

Менее вероятна, но возможна связь с географическим названием. В Польше и на западе Украины встречаются топонимы типа Гондалы, Гондалин. Тогда переселенец оттуда мог получить прозвище по месту выхода. Однако для фамилий на -енко такая модель менее характерна: они чаще образовывались от личных прозвищ, а не от названий деревень.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гондаль, Гондалюк, Гондаловский — все они восходят к тому же корню. Но Гондаленко — самая «прозрачная» по модели: суффикс -енко сразу указывает на украинское происхождение и на то, что фамилия закрепилась не позднее конца XVIII века, когда эта модель стала массово вытеснять патронимы на -ов и -ин. Носители фамилии, скорее всего, происходят из среды свободных крестьян или казацкой старшины, а не из шляхты, где преобладали фамилии на -ский.