Фамилия Гонус — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она напоминает латинское или греческое заимствование, но на деле, скорее всего, имеет чисто славянские корни, искажённые письмом или диалектом.

Ключ к разгадке — в суффиксе. В русских фамилиях типичные окончания «-ов», «-ин», «-ский». Здесь же мы видим «-ус». Такое окончание в славянской среде часто появлялось при полонизации или украинизации фамилии, а также при записи прозвища «на латинский манер» в канцеляриях XIX века. Однако основа «Гон-» указывает на глагол «гнать».

Самая правдоподобная версия: Гонус — это украинская или белорусская форма фамилии, образованной от прозвища Гон, Гонец или Гоня. Прозвище могли дать человеку, который постоянно куда-то спешил, был гонцом, скороходом, либо погонщиком скота (например, чумаком, гнавшим волов). В некоторых говорах «гоня» — это ещё и непоседа, беспокойный человек. Окончание «-ус» могло закрепиться в результате унификации фамилий по польскому образцу (сравните: Коваль — Ковалюс, Гоня — Гонюс, Гонус).

Менее вероятная, но возможная версия — связь с немецким «Hohn» (насмешка) или с латинским «honus» (груз, тяжесть). Однако для массового распространения фамилий среди крестьян и мещан такие заимствования нетипичны, а вот бытовое прозвище — вполне.

Географически фамилия Гонус встречается на западе России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает её западнорусское или малороссийское происхождение. В дореволюционных записях её могли писать как «Гонусъ» или «Гоннус», что говорит о нестабильности орфографии и возможном двояком произношении.

Таким образом, предки носителя фамилии Гонус, скорее всего, были людьми подвижными: гонцами, погонщиками или просто торопыгами, которых так и прозвали в своей среде. Фамилия — не дворянская, не книжная, а живая, прозвищная, и её форма — результат местной языковой обработки.