Фамилия Гоптенко — характерный пример украинской модели образования фамилий. Её основа — прозвище Гопта, а суффикс -енко указывает на прямое родство: так называли сына, потомка или ученика человека с прозвищем Гопта. В украинской ономастике суффикс -енко — один из самых распространённых, он заменил собой русские -ов/-ев и -ин, особенно в центральных и восточных регионах Украины.

Само прозвище Гопта, скорее всего, связано с глаголом «гопать» — прыгать, скакать. Этим словом в украинских говорах описывали резвого, непоседливого ребёнка или, наоборот, деловитого, напористого человека, который «прыгал» по делам. Есть и вторая, более конкретная версия: Гопта могло быть прозвищем лихого танцора гопака. Украинский танец гопак, название которого происходит от того же глагола «гопати», был настолько ярким явлением, что мог дать прозвище человеку, который его виртуозно исполнял или просто любил плясать.

Интересно, что фамилия Гоптенко — не единственная в этой группе. В украинской среде встречаются и однокоренные фамилии: Гопта, Гопак, Гопкало. Все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами, что показывает, как по-разному в разных семьях закреплялось прозвище. Гоптенко — одна из тех фамилий, где исходное прозвище не угасло, а передалось потомкам через типично украинский патронимический суффикс.

Географически фамилия Гоптенко тяготеет к восточным областям Украины и югу России, куда переселялись украинцы в XVIII–XIX веках. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении прозвища — возможно, в одном селе или группе сёл.