Фамилия Гаптенко — украинская по происхождению, что ясно по суффиксу -енко. В украинской ономастике этот суффикс — главный маркер фамилии: он означал «сын» или «потомок», а в XV–XVII веках именно так оформляли детей казаков и крестьян. Гаптенко — буквально «сын Гапты». В основе фамилии лежит прозвище Гапта, и его значение неочевидно — исследователи спорят.

Самая убедительная версия связывает Гапту с украинским словом «гаптар». Так называли мастера, который вышивал золотыми или серебряными нитями. Гаптарство было дорогим ремеслом: расшивали праздничную одежду, церковные облачения, убранство для знати. Если предок получил прозвище Гапта, то, скорее всего, он и был таким вышивальщиком — человеком, чьи руки делали вещи, которые носили и в церкви, и в богатом доме. Прозвище закрепилось за родом, а потом перешло в фамилию.

Есть и другая версия — от глагола «гопать», то есть прыгать, скакать. Тогда Гаптой могли прозвать подвижного, непоседливого ребёнка или взрослого с живым нравом. Иногда это слово связывают с гопаком — украинским танцем, который изначально был мужским, требовал силы и ловкости. Возможно, прозвище дали хорошему танцору. Но эта гипотеза чуть слабее: прозвища от ремесла встречаются чаще, чем от танцев, и «гаптар» даёт более прямую и понятную мотивировку.

Фамилия Гаптенко не самая распространённая, но её носители встречаются в центральных и восточных областях Украины — там, где традиционно жили казаки и ремесленники. В России фамилия редкая, что подтверждает её украинские корни. Сословной привязки нет: с суффиксом -енко фамилию мог получить и казак, и крестьянин, и мещанин — главное, что родоначальник был чем-то приметен и получил прозвище, которое запомнили.