Фамилия Горупащенко — украинская по происхождению, что выдает суффикс -енко, который в XVI–XVII веках закрепился в Поднепровье и Слобожанщине как основной патронимический формант. В буквальном смысле Горупащенко — это «сын Горупащего» или «потомок человека по прозвищу Горупащий». Но вот с основой сложнее: слово «горупащий» ни в украинских, ни в русских говорах словарями не фиксируется как нарицательное. Это значит, что перед нами либо сильно искаженное написание, либо местное прозвище, которое не вышло за пределы одного села или хутора.

Самая правдоподобная версия связывает Горупащенко с фамилиями на Гор- от глагола «горить» (гореть). Если предположить, что исходная форма звучала как Горопащенко (без «у»), то корень «гор-» мог относиться к человеку, связанному с пожарами, выжиганием леса под пашню (огневое земледелие) или просто с обгоревшим местом. Суффикс -ущ- в украинских прозвищах часто придавал усилительное или пренебрежительное значение: «горупащий» — тот, кто сильно горел, обгорел, либо кто сам «горит» в работе или в гневе. В таком случае фамилия могла закрепиться за крестьянином, чье хозяйство пострадало от огня, или за человеком с рыжими волосами (ассоциация с огнем).

Вторая гипотеза — контаминация с тюркским корнем «гор» (могила, холм) или «гура» (глухой, нелюдимый), но это менее вероятно для украинской фамилии с четким славянским суффиксом. Написание с «у» после «р» могло возникнуть под влиянием акающих говоров или просто из-за ошибки писаря, который записал прозвище на слух.

Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Черкасской и Полтавской областях, а также среди потомков переселенцев на Кубани. Сословно носители, скорее всего, были казаками или государственными крестьянами — в этих краях фамилии на -енко массово закрепились именно за свободным сельским населением, а не за шляхтой. Дворянских родов с такой фамилией не известно, что подтверждает ее народное, неофициальное происхождение.