Фамилия Готилова — женская форма, мужская — Готилов. В её основе лежит прозвище или некалендарное имя Готил. Сама основа Готил- звучит необычно для русского уха, и это подсказывает, что перед нами не исконно славянский корень, а скорее всего заимствование или переосмысление.

Наиболее вероятная версия — связь с тюркским миром. В тюркских языках есть слово «кот» или «гот» в значении «счастье», «удача», «благодать». Имя Готил могло быть образовано с уменьшительным суффиксом -ил, как, например, в именах Агил, Тимил. Тогда Готил — это «счастливчик», «баловень судьбы». Такие имена были распространены в среде татар, башкир, ногайцев, а затем перешли в русские фамилии после вхождения этих народов в состав Российского государства. Фамилия Готилов встречается в Поволжье, что косвенно подтверждает эту гипотезу.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от греческого имени Гот (Gothos) или от этнонима «гот» (представитель германского племени готов). Однако в русской ономастике такие прямые этнические прозвища редки и обычно имеют книжное, а не бытовое происхождение. К тому же, в этом случае фамилия звучала бы как Готов или Готский, а суффикс -ил указывает на уменьшительную, «домашнюю» форму, что характерно именно для прозвищ.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от имени или прозвища отца: «чей?» — Готилов, то есть сын Готила. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был человеком, которого в окружении звали Готилом — либо по имени, данному при рождении, либо за счастливый нрав.