Фамилия Готовкина образована от прозвища Готовка, а оно — от глагола «готовить». Тут сразу два возможных пути. Первый: «готовить» в смысле «быть готовым, поспевать к сроку, держать всё в исправности». В этом случае прозвище Готовка получал человек расторопный, бодрый, который всё успевает и всегда наготове. Второй путь — более бытовой: «готовить» как «стряпать, варить еду». Тогда прозвище закрепилось за искусным поваром или кулинаром, возможно, за тем, кто кормил всю артель или общину.

Суффикс -ин в окончании фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Готовкин, то есть сын или потомок Готовки. Эта модель — одна из самых распространённых в русских фамилиях, особенно на севере и в центральных областях России. В южных и восточных регионах чаще встречается форма Готовкин без чередования, но вариант Готовкина — это женская форма, которая в современном употреблении закрепилась за женщинами.

Поскольку основа прозвища — глагол, а не церковное имя, это типичная «мирская» фамилия. Она возникла не в среде духовенства или высших сословий, а в крестьянской или посадской среде, где прозвища давали по занятиям и чертам характера. Словарь Б. Унбегауна относит такие фамилии к разряду образованных от названий профессий и занятий, хотя в данном случае прямое указание на профессию — лишь одна из версий.

В написании фамилия устойчива: Готовкина — с буквой о в корне, без вариантов через а. Это отличает её от возможных однокоренных Готавкиных или Гатовкиных, которые могли бы возникнуть в диалектах с аканьем. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Гото́вкина.