Фамилия Груганова — женская форма фамилии Груганов, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Груган. В русской ономастике это довольно редкий случай: основа фамилии не имеет очевидных параллелей с распространёнными словами вроде «груша» или «груздь». Наиболее вероятная версия — связь с диалектным словом «груган», которое в некоторых говорах означало «ворчун», «брюзга» или «угрюмый человек». Сравните с глаголом «гругать» — ворчать, сердито бормотать. Таким образом, Груганом могли прозвать необщительного, вечно недовольного человека, и эта характеристика закрепилась за его потомками.

Суффикс -ов указывает на типичную модель образования русских фамилий в XVI–XVII веках: отчество от прозвища. Груганов — буквально «сын Гругана». Женская форма Груганова, соответственно, означает «дочь или жена Груганова». Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях, где диалектная лексика сохранилась лучше. В этих местах «груга» также могло означать «глухой звук» или «шум», что добавляет ещё один оттенок к возможному значению прозвища.

Менее правдоподобна, но всё же допустима версия о происхождении от тюркского корня. В татарском языке есть слово «груган» (вариант «кыруган») — «сломанный», «разбитый». Однако для русской фамилии это нетипично: суффикс -ов в сочетании с тюркской основой встречается реже, чем славянской. К тому же география фамилии не совпадает с зонами активного тюркского влияния. Поэтому версия с диалектным «ворчуном» остаётся основной.

В документах фамилия Груганов фиксируется с XVIII века: в переписных книгах Архангелогородской губернии встречаются крестьяне и посадские люди с таким прозвищем. Никаких дворянских корней или связи с известными историческими родами у неё нет — это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия. Сейчас Гругановых немного, и носители фамилии живут в основном на Русском Севере, что подтверждает её локальный характер.