Фамилия Губиев, скорее всего, имеет тюркские корни. В этом смысле она стоит в одном ряду с такими известными русскими фамилиями, как Тургенев (от прозвища Турген — «быстрый, скорый»), Аксаков (от Аксак — «хромой») или Булгаков (от Булгак — «беспокойный»). В основе фамилии лежит тюркское прозвище Губи, которое могло относиться к человеку с определёнными чертами характера или внешности. Точное значение этого корня требует уточнения: в некоторых тюркских языках «губи» может означать «защитник» или «страж», в других — быть вариантом личного имени.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединялся к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или -й. Форма Губиев буквально означает «сын Губи» или «потомок Губи». Эта модель типична для фамилий, возникших в среде, где тюркские прозвища адаптировались к русской антропонимической системе. Географически фамилия распространена преимущественно на Северном Кавказе, особенно в Осетии, где тюркские имена и прозвища исторически смешивались с местными традициями.

Если рассматривать версию происхождения от осетинского имени Губи, то оно могло быть связано с древним родовым именем или тотемом. В таком случае фамилия Губиев указывает на принадлежность к определённому роду или клану, что характерно для горских народов. Однако тюркская версия остаётся основной, так как суффикс -ев и структура фамилии типичны для русифицированных тюркских прозвищ, а не для исконно осетинских патронимов.

В любом случае, носители фамилии Губиев — это потомки человека, которого окружающие выделили каким-то прозвищем, а затем это прозвище закрепилось за его детьми и внуками как родовое имя.