Фамилия Губуров вряд ли связана с «губой» в анатомическом смысле — такое прозвище дали бы человеку с заметной губой, но тогда в основе лежала бы форма «Губин» (от прозвища Губа) или «Губанов» (от «губан» — большегубый). Губуров явно образована иначе, и ключ к разгадке — в суффиксе -ур.

В русских фамилиях суффикс -ур встречается редко и чаще всего указывает на заимствованную основу. Вероятнее всего, Губуров — это русифицированная версия фамилии тюркского или кавказского происхождения. В тюркских языках есть корень «губур» (или «кобур», «кубур») со значением «мешок», «сума», «кобура». Прозвище Губур могли дать кожевнику, шорнику или торговцу, который носил товар в переметных сумах. Другая версия ведёт к слову «губер» — так в некоторых диалектах называли холм, бугор, и фамилия могла означать «живущий на возвышенности».

Третья, менее очевидная, но правдоподобная гипотеза — связь с греческим именем Губурий (вариант Губарий). В Крыму и Приазовье были поселения греков, чьи фамилии на -ури, -уров адаптировались под русские окончания. Например, греческая фамилия Губуридис при переселении в Россию могла превратиться в Губурова, а затем в Губуров.

С точки зрения географии, фамилия Губуров нечастотна, но встречается в южных регионах России — в Ростовской области, Краснодарском крае, а также в Астраханской области, что косвенно подтверждает тюркские или греческие корни. Сословно носители фамилии могли быть как крестьянами, так и казаками — фамилии на -ов в южных областях часто закреплялись за служилыми людьми.

Таким образом, Губуров — не про внешность, а про род занятий или место жительства предка, причём, скорее всего, нерусского происхождения. Точную этимологию установить сложно из-за редкости фамилии, но тюркская версия с «кобурой» выглядит наиболее обоснованной: она объясняет и суффикс, и географию распространения.