Фамилия Губванова — женская форма от Губванов, и её разговорный характер виден сразу. В русской ономастике суффикс -анов встречается реже, чем -ов или -ин, и часто указывает на нестандартную основу: здесь он присоединён не к простому прозвищу, а к слову с уже имеющимся суффиксом -ан. Основа «Губва» или «Губван» — это не что иное, как вариант прозвища Губан, которое давали человеку с крупными, толстыми или оттопыренными губами. В диалектах «губан» означало «губастый», и такое прозвище было распространено в северных и центральных губерниях России. Форма Губван возникла, вероятно, из-за акающего произношения: «Губан» в безударной позиции могло звучать как «Губван», и это закрепилось в написании. Таким образом, Губванов — это «сын Губвана», то есть потомок человека с прозвищем, связанным с внешностью.

Географически фамилия редкая и тяготеет к Поволжью и Уралу. В метрических книгах XIX века встречаются единичные записи о Губвановых в Казанской и Вятской губерниях, что подтверждает её локальный характер. В отличие от фамилий на -анов, образованных от крестильных имён (например, Иванов), здесь основа — чисто прозвищная, без церковного корня. Это говорит о том, что предок носителя получил фамилию не по отцу, а по уличному прозвищу, которое закрепилось за родом. В современной России фамилия остаётся малочисленной — по данным телефонных справочников, её носителей не более нескольких десятков человек. Версия о связи с глаголом «губванить» (якобы «гнуть, ломать») не подтверждается диалектными словарями и является народной этимологией — корень здесь именно «губ-» в значении части лица.