Фамилия Губжоков происходит из адыгейской среды, где её основа — личное имя Губжок. Это фонетический вариант более древнего имени Губжук, которое складывается из двух корней: «губж» («сердящийся», «гневный») и «къо» («сын»). Такой состав характерен для традиционных адыгских имён-пожеланий: называя мальчика Губжоком, родители хотели, чтобы он вырос сильным, смелым, способным постоять за себя. Со временем имя закрепилось за потомками как фамилия по модели, типичной для адыгского ономастикона: к основе добавился русский суффикс -ов, обозначающий принадлежность роду.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: фамилия образована от антропонима, а не от прозвища по профессии или месту жительства. В адыгских фамилиях суффикс -ов (как и -ев, -ин) появился под влиянием русской паспортной системы XIX–XX веков, когда местные имена и родовые прозвания адаптировали к стандартам имперской бюрократии. Таким образом, Губжоков — это буквально «потомок Губжока».

Географически фамилия привязана к Адыгее и Краснодарскому краю, особенно к районам, где исторически живут адыги (черкесы). Встречается она и в Кабардино-Балкарии, но реже: там более распространён вариант Губжуков, сохраняющий исходную форму имени. Разница в написании — Губжоков против Губжуков — отражает местные диалектные особенности произношения и записи.

Стоит отметить, что в адыгской традиции имена с корнем «губж» не были редкостью: они входили в ряд мужских имён, подчёркивающих характер или темперамент. Однако сама фамилия Губжоков не относится к числу распространённых — это скорее редкий, локальный антропоним, что делает его особенно ценным для семейной истории. Никаких документальных свидетельств о дворянском происхождении носителей этой фамилии нет: в адыгском обществе фамилии такого типа носили в основном свободные крестьяне и воины-уздени, а не княжеские роды.

Если искать параллели, то однокоренные фамилии — Губжоков, Губжуков, а также более редкие Губжев или Губжевский — все восходят к тому же корню «губж». Разница между ними — в суффиксах и степени русификации. При этом основа «гневный сын» остаётся общей, напоминая о том, что имя давали с расчётом на будущую силу и отвагу мальчика.