Фамилия Гудайтис — яркий пример литовской модели образования фамилий, которая заметно отличается от русской. Её основа — имя или прозвище Гудас, а суффикс -айтис (в литовской записи -aitis) указывает на принадлежность к роду, чаще всего на сына. Другими словами, Гудайтис — это «сын Гудаса». Такая патронимическая модель очень распространена в Литве, и фамилии на -айтис, -унас, -енас составляют её исторический пласт.

Значение основы Гудас неоднозначно, и здесь лингвисты предлагают две версии. Первая, более поэтичная, связывает имя с литовским gūdas — «глубокая ночь». В таком случае Гудасом могли назвать младенца, родившегося в ночные часы. Вторая версия — бытовая и конкретная: слово gúdas в литовском языке означало «белорус». Прозвище Гудас мог получить человек, переехавший из белорусских земель, или тот, кого окружающие считали белорусом по говору или обычаям. Обе гипотезы имеют право на жизнь, и без точных сведений о конкретной семье выбрать между ними сложно.

В русском контексте фамилия Гудайтис встречается редко и почти всегда указывает на литовские корни. Она не получила массового распространения, как, например, фамилии на -ов или -ин, и сохранила своё оригинальное окончание. В архивах красноярского общества «Мемориал», например, отмечены литовцы Гудайтис Викторас Ионо и Гудайтис Кештутис сын Костаса — это подтверждает, что носители фамилии сохраняли национальную идентичность даже в Сибири. Для потомков Гудайтисов фамилия — это прямой маркер происхождения из Литвы или из пограничных с ней районов, где веками жили литовцы.