Фамилия Гунджуа на слух кажется необычной для русского уха, и это не случайно. Её происхождение почти наверняка связано с Западным Кавказом, а точнее — с Абхазией. Фамилия имеет ярко выраженную абхазскую (возможно, мегрельскую) основу и образована по модели, типичной для абхазо-адыгских языков.

Ключевой элемент — суффикс -уа. В абхазском языке этот суффикс широко используется для образования фамилий и указывает на принадлежность к роду или местности. Он аналогичен русскому окончанию «-ов» или грузинскому «-дзе». Таким образом, Гунджуа — это не прозвище, а родовое имя, отвечающее на вопрос «из какого рода?» или «чей?».

Основа фамилии — Гундж (или Гунджа). Её этимология менее прозрачна. Есть две основные версии, и обе имеют право на существование. Первая: в основе лежит абхазское слово, связанное с личным именем или прозвищем, которое со временем утратило прямое значение. Вторая: фамилия может восходить к топониму — названию местности или села в горной Абхазии, где жили основатели рода. В абхазской ономастике фамилии, образованные от названий ущелий или рек, не редкость.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Гунджуа стоит в ряду таких абхазских фамилий, как Адлейба, Ашуба, Зухба, Хагба. Все они построены по одному принципу: корень + суффикс принадлежности. В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине (Иван Гунджуа), и склоняется, если принадлежит женщине (у Анны Гунджуа), что типично для заимствованных фамилий.

Социально предки носителей фамилии Гунджуа, скорее всего, были свободными крестьянами-общинниками или воинами. В традиционном абхазском обществе фамилия была маркером не только кровного родства, но и определённого социального статуса и территории. Фамилия не указывает на конкретное ремесло, а скорее фиксирует родовую память о месте или родоначальнике.