Фамилия Гонджуа — редкий случай, когда географический адрес застыл в родовом имени. Её основа — абхазский топоним Гудаута или, точнее, его местная, диалектная форма. В абхазском языке звук «д» в некоторых говорах переходит в «дж», а окончание -уа — типичный абхазский суффикс принадлежности, указывающий на выходца из определённого места. Таким образом, носитель фамилии Гонджуа — это человек «из Гудауты», то есть из одноимённого города или района в Абхазии.

Словообразовательная модель здесь не славянская, а кавказская: основа (название места) + фамильный формант -уа. Такие фамилии распространены у абхазов и родственных им народов (например, абазинов). В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине, и может склоняться в женском варианте (Гонджуа — Гонджуе, Гонджуей), хотя на практике носители часто сохраняют её в неизменной форме.

Спорных версий происхождения немного, и все они слабы. Иногда Гонджуа пытаются связать с грузинскими корнями, но грузинские фамилии на -уа встречаются редко и имеют другую природу (например, отчество). Абхазское происхождение подтверждается и географией: подавляющее большинство носителей фамилии живут в Абхазии и в абхазской диаспоре (Турция, Сирия). Встретить Гонджуа в русских землях — исключение, связанное с миграцией XX века.

По социальному контексту: фамилия не указывает на ремесло или личное качество предка. Она — маркер родовой территории. В абхазском обществе такие фамилии были распространены среди всех сословий, от крестьян до князей, и не несли сословной окраски. Если ваш предок носил фамилию Гонджуа, он почти наверняка был уроженцем Гудаутского района, и его род сохранял связь с этим местом на протяжении поколений.