Фамилия Гупаисова — женская форма от Гупаисов, и её разбор начинается с неочевидного: корень здесь не славянский, а еврейский, а суффиксальная часть хранит следы древней модели образования. Скорее всего, Гупаисов — это фонетический вариант фамилии Гапаисов. В ней отчётливо выделяются два компонента: приставка Га- (артикль принадлежности к роду, аналог «из дома такого-то») и суффикс -ис, который в еврейской ономастике указывает на происхождение от конкретного лица. Такая модель — артикль плюс имя плюс суффикс — типична для фамилий, сформировавшихся в среде горских евреев Кавказа или евреев Израиля.

В основе фамилии Гапаисов лежит мужское имя Паи. Его переводят как «судящий по правде» — имя с прозрачной семантикой, отсылающей к справедливости. Исходное имя Паи дало основу, к которой добавили артикль Га- и суффикс -ис, а затем — славянский патронимический суффикс -ов, который «обрусел» фамилию при записи в документах Российской империи. Переход Гапаисов в Гупаисов — чисто фонетический: безударное «а» в первом слоге могло произноситься как нечто среднее, а на письме закрепилось «у».

Интересно, что ашкеназские евреи обычно оформляли фамилии формантами -сон, -зон, -ман, -кинд, -штам, -бейн или -ер. Здесь же мы видим совсем другой путь: грузинский суффикс -швили («дитя») у горских евреев Кавказа — явление известное, но в случае Гупаисова использована иная, также неашкеназская модель: артикль Га- + имя + суффикс -ис. Это сближает фамилию с фамилиями евреев, живших в среде, где не было массового ашкеназского влияния, — возможно, на Кавказе или в общинах, говоривших на горско-еврейских диалектах.

Таким образом, предок носителя фамилии Гупаисов, скорее всего, был человеком по имени Паи, а сама фамилия в исходной форме Гапаисов значила «потомок (или член рода) того, кто судит по правде». В русском обиходе приставка и суффикс утратили первоначальный смысл, а фамилия закрепилась в варианте Гупаисов, который сегодня воспринимается как редкая и неочевидная по корню.