Фамилия Гурушкины, как и большинство русских фамилий на -ин, образована от личного имени или прозвища предка. В её основе лежит имя Гурушка — уменьшительно-ласкательная форма нескольких разных имён, поэтому у фамилии есть несколько версий происхождения.

Самая вероятная версия связывает Гурушку с церковным именем Гурий. Имя Гурий пришло на Русь с христианством, а в переводе с древнееврейского означает «львёнок» (от «гур» — детёныш). В народной речи имя сокращали и смягчали, превращая в Гуря, Гуруня, а затем и в Гурушка. По этой модели образованы и другие фамилии: Гурьев, Гурин, Гурьянов. Если придерживаться этой версии, Гурушкины — потомки человека по имени Гурий, которого в быту звали ласково Гурушкой.

Вторая версия отталкивается от того же корня «гур», но не от полного имени, а от еврейского слова «гур» — «детёныш зверя». В этом случае имя Гурушка могло быть чисто прозвищным, напрямую указывающим на качества человека: ловкость, молодость или даже внешнее сходство со звериным детёнышем.

Менее распространённые гипотезы выводят прозвище Гурушка из диалектной лексики. В украинском языке есть слово «гура» — «куча», «насыпь». Прозвище могло характеризовать полного человека или того, кто работал с сыпучими материалами. Ещё одна версия — профессиональная: от слова «гуральня» (винокурня). В этом случае Гурушкой называли винокура — человека, занятого производством спиртного. Это редкий, но возможный вариант для западных регионов, где гуральни были распространены.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Гурушкин, то есть сын или потомок Гурушки. Такая модель типична для северных и центральных областей России. О точном месте возникновения фамилии говорить сложно — процесс формирования фамилий длился несколько столетий, и имя Гурушка могло независимо появиться в разных регионах.