Фамилия Гужаковская — редкий случай, где географическое имя встретилось с неочевидной основой. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Гужаковский, переоформленный по женскому роду (для замужней женщины или вдовы). Мужской вариант, Гужаковский, типичен для шляхетской традиции Речи Посполитой: суффикс -ский указывает на владельческий или топонимический признак, то есть на связь с местностью.

Корень «Гужак» или «Гужака» — вот где начинается неопределённость. Самое прямое объяснение: от слова «гуж» — петля в упряжи, ремень, которым крепили оглоблю к дуге. В таком случае Гужаком могли прозвать человека, делавшего или продававшего гужи, либо того, кто был связан с извозом. Менее вероятно, но допустимо, что основа восходит к украинскому или белорусскому диалектному «гуж» в значении «верёвка» или «шнурок» — тогда прозвище мог получить портной или шорник.

Вторая версия — от древнего славянского имени Гуж или прозвища Гужа. В старых польских и белорусских метриках встречаются личные имена с основой «гуж-», но они редки и не имеют общепринятой этимологии. Возможно, это сокращение от какого-либо двусоставного имени (вроде Гурислав), но доказательств нет.

Географически фамилия Гужаковская и её мужской аналог тяготеют к западным областям Беларуси и восточным землям Польши — бывшим территориям Великого княжества Литовского. Там топонимические фамилии на -ский были нормой для мелкой шляхты и зажиточных крестьян, получивших землю. В России фамилия встречается единично, чаще всего у потомков переселенцев или репатриантов.

Написание с «-а-» во втором слоге (Гужаковская, а не Гужовская) говорит о том, что в основе лежит форма «Гужак», а не «Гужок» или «Гужов». Это дополнительный аргумент в пользу прозвищного происхождения: «Гужак» — тот, кто имеет отношение к гужу, либо увеличительная форма от «гуж». В любом случае, носительница фамилии может с высокой вероятностью считать своими предками либо ремесленников-шорников, либо мелких землевладельцев из западнорусских земель, чья фамилия закрепилась по названию усадьбы или хутора.