Фамилия Гужиян — армянская по происхождению, и её основа, скорее всего, указывает на национальность предка. В армянской традиции фамилия (по-армянски «азганун») буквально означает «имя клана» или «имя рода». Формант -ян (а также его варианты -янц, -енц) в армянских фамилиях — это патронимический суффикс, который первоначально означал «из семьи таких-то» или «из рода таких-то». Соответственно, фамилия Гужиян поначалу имела значение «из рода Гужи» (или Гуржи).

Скорее всего, изначально фамилия звучала как Гуржиян, а упрощение произошло в устной речи — «р» могло выпасть для удобства произношения. Основа Гуржи (Гужи) восходит к крымско-татарскому слову «гурджи», что означает «грузин». Это прозвище давали человеку, который жил не в своей этнической среде — например, грузину среди армян или татар, либо армянину, имевшему грузинские корни или долго жившему в Грузии.

Стоит отметить, что происхождение самого названия «Грузия» спорно. Ряд исследователей связывает его с греческим словом, означающим «страна земледельцев», другие полагают, что оно произошло от имени святого Георгия. Но для значения фамилии это не принципиально: в любом случае прозвище Гуржи (Гужи) указывало на связь с Грузией или грузинами. Таким образом, носитель фамилии Гужиян — потомок человека, которого в своей среде называли «грузином», возможно, за внешность, диалект или место рождения.