Фамилия Гылыков образована от бурятского мужского имени Гылык. По одной из версий, оно восходит к тибетскому слову «гэлэг» - «счастье, удача, процветание». Согласно другой гипотезе, в основе этого имени лежит тюркское слово «гөлөг» - «почка, щенок».