Фамилия Ибатжан — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычную модель русских фамилий на -ов/-ев или -ин, и это сразу подсказывает её происхождение: перед нами не исконно славянская, а тюрко-персидская или арабо-мусульманская фамилия, которая сохранилась в исходной форме, без русификации суффиксом.

Основа фамилии — составное личное имя Ибатжан. Первая часть, «Ибат», восходит к арабскому «ибада» (عبادة) — «поклонение», «служение Богу». В тюркских языках это слово часто давали как имя, подчёркивая религиозность. Вторая часть, «жан» (от персидского جان — «душа», «жизнь»), — распространённый компонент в мусульманских именах (например, Айжан, Гульжан, Нуржан). Вместе Ибатжан означает что-то вроде «душа поклонения» или «жизнь, посвящённая служению».

Такие двусоставные имена типичны для казахской, узбекской, татарской, башкирской и других тюркских антропонимических систем. Фамилии, образованные от полной формы имени без добавления суффикса, — особенно характерны для советского периода, когда у многих народов Средней Азии и Казахстана шёл процесс закрепления фамилий. До этого Ибатжан могло быть личным именем или отчеством (например, Ибатжан-улы). В метриках и паспортах имя просто перешло в фамилию.

Географически фамилия Ибатжан чаще всего встречается в Казахстане, Узбекистане и Киргизии, а также среди диаспор этих народов в России. В русскоязычной среде она остаётся экзотичной и почти не имеет однокоренных вариантов — сравните с более частыми Ибатуллин или Ибадов, где арабский корень «ибад» уже обработан русскими суффиксами.

Носитель фамилии Ибатжан, скорее всего, потомок человека, которого в семье называли по имени, подчёркивающему набожность. Никаких сословных или профессиональных оттенков у этой фамилии нет — она целиком построена на личном имени, а не на прозвище или должности.