Фамилия Ибикенова — редкий случай, когда географический и этнический след прослеживается почти однозначно, а вот с корнем слова всё сложнее. Это женская форма фамилии Ибикенов, и её происхождение, скорее всего, связано с тюркским или кавказским миром.

С точки зрения словообразования, фамилия построена по самой распространённой в русской среде модели: основа + суффикс -ов/-ев, который указывает на принадлежность («чей?»). В данном случае основа — Ибикен. Суффикс -ов в сочетании с конечным -ен даёт типичную русскую фамилию, которая могла возникнуть при оформлении документов в XIX–XX веках у народов, переходивших на русскую паспортную систему. Окончание -а в Ибикенова — показатель женского рода.

Самая вероятная версия корня — казахская или ногайская. В казахском языке есть имя Ибекен, где «Ибе» — это, возможно, усечённая форма от Ибрагим или Ибадулла, а «кен» — уменьшительно-ласкательный суффикс (как в именах Бекен, Серкен). Тогда Ибекен — «маленький Ибрагим». Фамилия Ибикенова могла закрепиться за потомками человека по имени Ибекен. Вариант с буквой «и» во втором слоге (Ибикен) — это либо диалектное произношение, либо описка писаря, что в истории фамилий не редкость.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с арабским словом «ибака» (бегство, спасение) или тюркским глаголом «ибик» (сгибаться, наклоняться). Однако такие прозвища обычно давали по конкретному поступку или внешности, и они редко образовывали фамилии с суффиксом -ен. Поэтому версия с личным именем Ибекен выглядит куда правдоподобнее.

Географически фамилия Ибикенова встречается в основном в Казахстане, особенно в Западно-Казахстанской и Атырауской областях, а также среди ногайцев Ставрополья. Встречаются единичные носители в Башкортостане и Татарстане, что подтверждает тюркскую основу. Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или скотоводческим — фамилии такого типа часто получали простые кочевники или сельские жители при записи в метрические книги. Дворянских корней у неё нет: суффикс -ов здесь не признак знатности, а стандартный способ русификации.