Фамилия Ифоди — редчайший случай в русском ономастиконе. Её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. В русском языке нет слова «ифод» или «ифода», которое могло бы лечь в основу прозвища или имени. Это сразу указывает на заимствованный характер фамилии, скорее всего, из греческого или церковного обихода.

Наиболее вероятная версия — фамилия восходит к церковному имени Феодот (греч. Theodotos — «богом данный»). В русской традиции это имя давало множество форм: Федот, Феодот, а в просторечии — Ифод. Такое стяжение начального слога «Фео-» в «И-» встречается в диалектах и народной этимологии: имя Феодор превращалось в Иодор, а Феодот — в Ифод. Суффикс -и на конце (Ифоди) — это либо родительный падеж в форме «чей?» (Ифодий → Ифоди), либо, что вероятнее, фамилия застыла в форме множественного числа или родительного падежа, как это бывает у фамилий на -их/-ых (например, Ифодих). Однако написание без «х» говорит о том, что фамилию могли записать по принципу «Ифоди» как сокращённый вариант от «Ифодин» или «Ифодьев».

Географически носители фамилии Ифоди встречаются в основном на юге России и в Запорожье, что косвенно подтверждает связь с греческой диаспорой или с казачьей средой, где церковные имена переиначивали на свой лад. Спорных версий немного: иногда фамилию пытаются возвести к тюркскому корню, но убедительных параллелей нет. Правдоподобнее всего, что предок носителя фамилии Ифоди — человек, которого в быту звали Ифод (от Феодот), а его дети получили фамилию по отцу. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от канонических имён, пусть и в необычной народной обработке.