Фамилия Ильчекес — редкий пример, где тюркская основа соединилась с русским суффиксом принадлежности. Разберём её по частям.

Корень «Ильче» восходит к тюркскому слову «илче» (посол, представитель, вестник). В тюркских языках «ил» — народ, страна, племя, а «-че» — суффикс деятеля. То есть «ильче» — это посланец, человек, выполняющий поручения от имени рода или государства. Прозвище Ильче могли дать дипломату, гонцу или толмачу, который вёл переговоры между русскими и тюркскими соседями.

Конечное «-кес» — это русский патронимический суффикс, но в необычной огласовке. В русских фамилиях чаще встречается «-кин» (от «князь» — Князькин), «-ков» или «-цев». Здесь мы видим суффикс «-ес», который в XVI–XVII веках использовали для образования фамилий от тюркских имён и прозвищ на «-ча», «-че». Сравните: Алымов (от Алым), но Ильчекес — буквально «сын Ильчи». Такой суффикс встречается в фамилиях казанских татар и мишарей, перешедших в православие, а также у служилых тюрков на южных рубежах России.

География фамилии узкая. Ильчекесы встречаются в Поволжье (Татарстан, Башкирия, Самарская область) и на Урале. Это совпадает с зоной расселения татар-кряшен (крещёных татар) и служилых мещеряков. В XVIII–XIX веках такую фамилию могли зафиксировать у ясачных крестьян или отставных солдат, которые сохранили тюркское прозвище в качестве родового имени.

Версия о связи с турецким «ilçe» (район, административная единица) маловероятна: это слово появилось в османском турецком поздно и не встречается в русской антропонимии. Также не стоит путать фамилию с казахским именем Илькес (от «ел» — народ, «кес» — отрезать) — это другое имя с другим значением.

Итог: фамилия Ильчекес — редкий след тюркского дипломата или гонца, который осел на русской службе и передал потомкам прозвище, оформленное по русской модели с нестандартным суффиксом.