Фамилия Ильчишин — один из примеров того, как народная речь переработала церковное каноническое имя. В её основе лежит имя Илья, которое пришло на Русь вместе с христианством из древнееврейского языка, где оно означает «мой Бог — Господь», то есть «мой Бог — Бог истинный».

Но на этом история не заканчивается. Фамилию образовали не напрямую от полного имени Илья, а от его производной, уменьшительной формы — Ильчиша. Это характерная черта для многих русских фамилий на -ин: сначала от полного имени появляется обиходный, «домашний» вариант (вроде Ильчиша, Гавриша, Даниша), а затем он закрепляется в качестве фамильного прозвища. Суффикс -ин в данном случае указывает на принадлежность: Ильчишин буквально означает «сын Ильчиши» или «потомок Ильчиши».

Такая модель словообразования — от краткой формы имени через суффикс -ин — типична для северных и центральных областей России. В южных и западных регионах чаще использовали суффиксы -енко, -ук, -ович. Поэтому, хотя точное место возникновения фамилии Ильчишин сейчас установить трудно, её форма сужает круг поисков: скорее всего, предки носителя фамилии жили в зоне бытования «икающих» говоров, где имя Илья в ласкательной форме звучало как Ильчиша.

Стоит отметить, что фамилия Ильчишин — не единственная в этом гнезде. Однокоренные Ильчишины, Ильины, Ильюшины, Ильченко — все они восходят к одному источнику, имени Илья, но различаются по способу образования и, как следствие, по географии распространения. Модель на -ин, как в случае с Ильчишиным, считается более древней и архаичной по сравнению с патронимами на -ов/-ев, которые в русском языке стали доминировать позднее.