Фамилия Ильдуганов — редкий пример, в котором тюркское имя и русский суффикс сплелись в один клубок, не давая однозначного ответа, кто был предком. Первое, что бросается в глаза: основа «Ильдуган» явно не славянская, а окончание «-ов» — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?»). Значит, перед нами фамилия, образованная от личного имени или прозвища Ильдуган, которое носил родоначальник.

Самая вероятная версия ведет в тюрко-монгольский мир. Имя Ильдуган можно разбить на две части: «иль» (страна, народ, племя) и «дуган» (друг, родственник, а в некоторых диалектах — «рожденный»). Получается что-то вроде «друг народа» или «рожденный для страны». Такие имена-пожелания были распространены у татар, башкир, ногайцев и других народов Поволжья и Урала. Не исключено, что Ильдугановы — потомки служилых татар или башкир, которые после присоединения этих земель к Русскому государству переходили на русскую службу и получали фамилии по отцу.

Есть и более редкая, но лингвистически возможная версия: связь с калмыцким или монгольским «илд» (меч, сабля) и «ган» (сталь). В таком случае Ильдуган могло быть прозвищем воина, мастера клинков или просто человека с острым, решительным характером. Однако эта гипотеза слабее: конечное «-ан» в монгольских именах встречается реже, чем в тюркских.

Географически фамилия плотнее всего привязана к Оренбуржью, Башкортостану и Татарстану. Встречаемость крайне низкая — это не массовая фамилия, что говорит о ее относительно позднем оформлении (скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда у крестьян и инородцев массово закрепляли фамилии по отцу). Суффикс «-ов» вместо более тюркского «-ин» или «-ев» — еще один аргумент в пользу того, что фамилию давали в русской канцелярии или при крещении.

Интересная деталь: если бы фамилия писалась через «а» в конце (Ильдугана), она могла бы быть матронимом (по матери), но твердое «-ов» однозначно указывает на отца. Так что носитель этой фамилии с большой вероятностью ведет род от человека по имени Ильдуган, жившего в степном или лесостепном пограничье между Русью и кочевым миром.