Фамилия Иматра — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с русскими фамильными моделями. Самое прямое объяснение — топонимическое: Иматра — это название знаменитого порога на реке Вуокса в Финляндии. Если предки носителя фамилии были выходцами из тех мест, переселенцами или имели финские корни, фамилию могли дать по месту жительства. В пользу этой версии говорит и отсутствие в русском языке слова «иматра» с каким-либо бытовым значением — прозвищной основы для неё просто нет.

Словообразовательно фамилия стоит особняком. В ней нет типичных русских суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский), которые оформляли бы её как притяжательную или географическую. Иматра — это чистая основа, застывшая в форме именительного падежа. Такое возможно, если фамилию записывали со слов носителя-иностранца или если она возникла в среде, где русские патронимические суффиксы не применялись (например, у финнов-ингерманландцев или карел, живших на территории Российской империи).

Менее вероятная, но допустимая версия — искусственное происхождение. В XIX — начале XX века в духовных училищах и семинариях ученикам нередко давали «благозвучные» фамилии по названиям рек, городов, античных героев. Иматра как экзотическое и звучное слово могла попасть в список таких новообразованных фамилий для семинариста. Однако прямых документальных подтверждений этому нет, и большинство носителей фамилии, судя по современным данным, сосредоточены в регионах, близких к исторической Ингерманландии (Ленинградская область, Карелия, Санкт-Петербург), что указывает на реальную географическую привязку.

Однокоренных русских фамилий у Иматры нет. Встречаются лишь единичные случаи фамилий Иматров или Иматрин, но они, скорее всего, возникли уже позже как русифицированные варианты исходной Иматра. Таким образом, фамилия — скорее всего, северный топонимический след, сохранивший память о финском водопаде в фамилии русского или финского жителя приграничья.