Фамилия Индерякин — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который присоединяется к основам на -а/-я. В данном случае исходной формой было прозвище или неканоническое имя Индеряка. Суффикс -як в русских прозвищах часто указывал на носителя характерного признака или на происхождение из определённой местности (ср. Сибиряк, Пензяк, Тамбовец). Таким образом, Индеряка — это человек, которого так прозвали, а Индерякин — его потомок.

Ключевой вопрос — что означает корень «индер». Наиболее правдоподобная версия связывает его с тюркскими языками, в частности с татарским или башкирским. Слово «индер» (или «индэр») в некоторых тюркских диалектах может означать «пещера», «логовище», «овраг». В таком случае прозвище Индеряка могли дать человеку, жившему у оврага или в глухом месте. Альтернативная, менее обоснованная версия выводит корень из личного имени Индер (возможно, искажённого тюркского имени, например, Индир или Индербек), но для этого нет надёжных исторических подтверждений.

Суффикс -як в русской ономастике мог выполнять и уменьшительную, и уничижительную функцию, но в основе прозвищ он чаще нейтрально-описательный. География фамилии узкая: она встречается в Поволжье, особенно в Ульяновской области и Татарстане, что косвенно подтверждает её тюркское происхождение. Встречаются также варианты написания Индеряков, но это уже вторичная русификация через суффикс -ов.

В сословном отношении носители фамилии Индерякин, скорее всего, были государственными крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, которые несли сторожевую службу на южных и восточных рубежах России. Прямых указаний на дворянство или известных исторических личностей с этой фамилией нет. Фамилия осталась локальной, не получив широкого распространения за пределами своего ареала.