Фамилия Иншутина — женская форма фамилии Иншутин. Она образована по типичной для русских фамилий модели: к основе мужской фамилии на -ин добавляется окончание -а. Сама же фамилия Иншутин, скорее всего, произошла от прозвища или канонического имени, подвергшегося народной переработке.

Наиболее вероятная версия возводит основу к имени Инша. Это уменьшительная форма от крестильного имени Иннокентий (от латинского «innoceus» — невинный, безвредный). В русской народной традиции длинные имена часто усекали до коротких и удобных в быту: Иннокентий — Кеша, Инша. Суффикс -ут- в данном случае — нестандартный. Обычно фамилии образуются с суффиксом -ин (Иншин), но здесь мы видим расширение -ут-, которое могло указывать на принадлежность к кому-то: «Иншута» — сын или человек Инши. Такая модель встречается в северных и сибирских говорах, где суффикс -ут-/-утя придавал оттенок ласкательности или, наоборот, принадлежности к роду.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «инша», которое в некоторых областях означало «иная», «другая» или относилось к чему-то чужому. В этом случае прозвище Иншута могли дать пришлому человеку, нездешнему, или тому, кто держался особняком. Однако прямая связь с крестильным именем выглядит надёжнее: фамилии на -ин от имён — самый массовый пласт русских фамилий.

Географически фамилия Иншутин (и Иншутина) встречается не повсеместно, а тяготеет к Уралу и Сибири. Это косвенно подтверждает версию о северном происхождении суффикса: именно из Поморья и Приуралья шло заселение Сибири. В старых переписях XVII–XVIII веков на Урале фиксировались крестьяне и посадские люди с такой фамилией — предки современных Иншутиных, скорее всего, были свободными землепашцами или ремесленниками, а не дворянами.

Однокоренные фамилии — Иншин, Иншутов, Иншаков. Разница в суффиксах отражает местные особенности произношения и словообразования, но все они восходят к одному корню — имени Инша.