Фамилия Иоаннисиан — это русская запись армянской фамилии Ованнисян. Она образована от армянского имени Ованнес, которое является местным аналогом библейского имени Иоанн (в русской традиции — Иван). Суффикс -ян в армянском языке указывает на принадлежность, происхождение, то есть «из рода Ованнеса», «сын Ованнеса». Русское окончание -иан, а не -ян, появилось потому, что в XIX — начале XX века, когда армянские фамилии записывали в российских документах, их часто «обрусевали», добавляя окончание по аналогии с греческими или грузинскими фамилиями на -иан, -иани. Так Ованнисян превратился в Иоаннисиан — с церковнославянским «Иоанн» вместо народного «Ованнес». Это не ошибка, а историческая особенность передачи звуков.

Разберём основу. Имя Иоанн (через греческое Ἰωάννης) восходит к древнееврейскому Йоханан — «Яхве (Бог) смилостивился», «Бог даровал». В Армении это имя стало одним из самых распространённых, поэтому и фамилия Ованнисян — одна из частых. Носители фамилии Иоаннисиан, как правило, имеют армянские корни, но фамилия закрепилась именно в русскоязычной среде, часто у потомков армян, переселившихся в Российскую империю или живших в Тифлисской, Эриванской губерниях, где документация велась по-русски.

По социальному контексту: фамилия не указывает на конкретное ремесло или сословие. Её носителями могли быть и крестьяне, и священники (имя Ованнес часто давали духовенству), и купцы. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто маркируют профессию или прозвище предка, армянские фамилии на -ян почти всегда патронимические — указывают на имя отца. Поэтому главный ответ на вопрос «кем были предки» — они были людьми, чьего отца или деда звали Ованнесом (Иоанном).

Интересная деталь: в самой Армении фамилия пишется как Հովհաննիսյան (Ованнисян), и звук «х» в начале (Հ) часто опускается в русской передаче. Вариант Иоаннисиан встречается реже, чем просто Ованнисян или Оганесян, и характерен именно для старой, дореволюционной записи. Если вы встретили такую фамилию в современных документах, скорее всего, это потомки тех, кто сохранил написание, данное при паспортизации в XIX веке.