Фамилия Иоан — редкий случай в русском ономастиконе. Она не образована по стандартной модели русских фамилий (с суффиксами -ов, -ин, -ский), а представляет собой застывшую форму личного имени Иоанн — церковнославянского варианта имени Иван. В отличие от фамилии Иванов, которая означает «сын Ивана», Иоан — это прямая, неадаптированная запись имени в качестве наследственного прозвания.

Как такое могло появиться? В русской традиции фамилии на -ов и -ин возникли в XV–XVII веках у знати и служилых людей, а у крестьян закрепились после отмены крепостного права. Фамилия Иоан, скорее всего, сформировалась не в крестьянской среде, а в церковной или семинарской. В духовных училищах и семинариях в XVIII–XIX веках часто давали фамилии по церковным праздникам, именам святых или просто по латинизированным и эллинизированным формам русских имён. Иоан — это как раз такой случай: будущий священник или дьячок мог получить фамилию по своему имени в торжественной, книжной форме.

Географически фамилия встречается нечасто, но имеет выраженную привязку к югу России и Украине, а также к регионам, где было сильно влияние греческой и южнославянской письменной традиции. В некоторых случаях Иоан могла быть русификацией греческой фамилии Иоанну или румынской Иоан. В любом случае, носитель этой фамилии с высокой вероятностью происходит из среды, где имя ценили не как бытовое, а как каноническое, церковное — либо предок был грамотным человеком при храме, либо получил фамилию в учебном заведении.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: у неё нет суффикса, который указывал бы на родство («чей сын?»), она сразу называет человека. Это сближает её с фамилиями типа Георгий, Василий, Александр — все они тоже редкие и обычно указывают на искусственное, книжное происхождение. В отличие от них, Иоан сохранила древнее написание с одной «н» в корне (в имени Иоанн — две «н»), что может быть следствием орфографической ошибки при записи или влиянием южнославянских языков, где двойные согласные не характерны.